Tolpa,
я конечно поищу в свободное время что-нибудь что могло бы решить вашу проблему, но вот что я думаю об установке начисто
почти все настройки хранятся в папке пользователя, все программы можно поставить одной командой
в конце концов можно накатать скрипт и устанавливать все по ssh(из того же net-install образа, для экономии трафика можно временно сделать локальную копию репозитория с нужными пакетами)
это те варианты которые первые приходят в голову, я никогда подобным не занимался и почти уверен что есть способ оптимальнее...