Riuga,
а есть сбросить настройки браузера? (временно)
удалить кэш, удалив папки
~/.cache/google-chrome
Переименовать папку
~/.config/google-chrome
Это скрытые файлы настроек, для их отбражения в Nautilus надо нажать Ctrl+H.
Настройки не удалятся, но браузер сбросится на настройки по умолчанию с отключением всех дополнений. И сразу же проверить работу Flash на том сайте. Если будет работать - значит что-то с настройками, или какие-то плагины мешают.