~/.kde и ~/.config-то за что удалять? Достаточно вычислить каталог с настройками программы и грохнуть только его.
Читай внимательно, первым было "Сделай бэкап"
Проще сказать, бэкапь всю папку, чем объяснять, что нужно в .kde удалить/переместить конфиги плазмы, конкретной программы, из .config - папки гтк2, гтк3.
Проверяем наличие проблемы. возвращаем все на место
Если проблема в конфигурациях, то начинаем уже последовательно вычислять, какая сволочь у нас собаку порыла и где
Пользователь решил продолжить мысль [time]03 Март 2015, 02:01:20[/time]:
Только сейчас добрался до картинки. По-моему, надо копать в сторону наличия иконок в конкретной используемой теме значков. Например, если заменить текущую тему на какую-то из ранее используемых, значки вернутся? Если да, то никаких конфигов удалять не надо.
Как вариант. ТС надо проверить настройки Панель управления/оформление приложений/настройка GTK+/раздел "Темы значков" выставить резервной темой туже Нumanity или Гном.
Если значков нет в основной, то они должны подхватиться из резервной