Не знаю, возможно ли. И вряд ли кто знает. Ибо Wubi - зло, и поэтому мало кто им пользуется, тем более в таком извращённом виде.
Надёжнее будет удалить поставленную через Wubi Ubuntu 14.04 из Windows (она встала как обычная виндовая программа) и установить и 14.04 и 12.04 нормально, выделив для каждой специальные разделы на винчестере. Это будет правильно.
Ну и вы уверены, что вам нужна 12.04? Она, конечно, LTS, но не думаю, что там есть что-то, чего нет в 14.04 LTS. Разве что "глобальное меню" полностью отключить легче и предложения загрузки в меню менее назойливы.