V@,
CherryTre, кстати сказать, последней пользуюсь достаточно давно и ни-разу данные сами собой не исчезали... да и вообще, такое вряд ли возможно, скорее, ты сам неосознанно что-то удалил или реструктуризовал 
ЗЫЖ Вбей в поиске Центра приложений Ubuntu что-то типа замет и тебе будет предложено несколько десятков программ, выбирай
Экспортировал свои данные в формат CherryTree, с таким окончанием Man.ctb, весит 41кБ.
Открываю его и ничего, пусто совсем,пробовал переустанавливать и удалять конфиги.
Сама же прога работает в Ubuntu 14.04 не совсем корректно ctrl+z возвращает на самое начало! вместо возврата на одно изменение, такая же проблема с ctrl+y, ну и так по мелочи.
CherryTree версия 0.32.0.(3 потраченных часа и потеря...

)
Пользователь решил продолжить мысль [time]05 Июль 2015, 15:42:40[/time]:
V@,
TuxCards — иерархическая записная книжка для ввода и управления любыми типами заметок и идей в структурированной форме. Позволяет использовать в заметках форматированный текст и изображения.
TuxCards - нормальная прога, но нет локализации совсем, да и вроде других форматов не поддерживает как cherrytree(
ЗЫЖ Вбей в поиске Центра приложений Ubuntu что-то типа замет и тебе будет предложено несколько десятков программ, выбирай
ЗЫЖ звучит конечно заманчиво), но я не знаю что это...
Пользователь решил продолжить мысль 05 Июля 2015, 14:50:55:
Установил последнию версию CherryTree 0.35.8 лучше наверное нет.