stslit, так, ты попросту заменил загрузчик

А grub восстанавливается одной командой:
grub-install --boot-directory=/путь/до/boot /dev/sdX
где /путь/до - место, куда ты примонтировал восстанавливаемую систему
sdX, соответственно - твой диск.
А lilo давно уже никто по умолчанию не использует.