Смотря что ты имеешь ввиду, если ты полностью будешь переустанавливать ОС то естественно все удалиться, если плановое обновление, предположим 15.04 на 15.10, то измениться только / хомяк выживет, но в любом случае лучьше подстроховаться.
Надеюсь понял.
Да и еще можно переустоновить только / раздел, хомяка не трогать, все личное останется, но лучьше подстроховаться.
Перед переустановкой скопируй все важное на носитель (флэшь, сд)