neygomon, не совсем понятно, 3 секунды - это время запуска Windows, а 20 сек. - Ubuntu? Если да, то дело не в fast boot, скорее всего в Windows включена гибернация. Если её выключить - время загрузки Windows перестаёт быть волшебным.
Но нам же нужно не увеличить время загрузки Windows, а сократить время загрузки Ubuntu, я так понимаю? Тогда огорчу, 3-х секунд вы точно не добьётесь: гибернация в Ubuntu работает не стабильно (давняя проблема) и по умолчанию отключена.
Опять не понятно, NTFS-раздел к Ubuntu у вас монтируется автоматом или только только после того, как вы его щёлкните мышкой в файловом менеджере? Как настраивали монтирование? Вообще, первым делом лучше выключить ту самую гибернацию в Windows, тогда с большой вероятностью проблемы с монтированием исчезнут (или минимизируются).
Опять же, вы Ubuntu устанавливали в режиме UEFI? Если нет, то с "fast boot" будет запускаться только Windows, а Ubuntu только без "fast boot" в настройках UEFI.