ersx,
значит проблема в настройках пользователя. ctrl+H покажет скрытые файлы (с точкой в начале имени), сложность в том как найти где конкретно проблема (файлов и папок много). Как вариант, создать юзера test, скопировать свои настройки ему, загрузится из него, убедится что проблема проявила себя, удалять по одной папки настроек, после удаления перезаходить в сеанс. Найдя источник удалить его в основного юзера. Или второй вариант удалить все сразу и заново настроить.
Такие папки как .wine .mozilla .Skype трогать не нужно (это настройки программ, с их имени думаю понятно)