Да, там где-то в конфигах аконади остается часть настроек, плюс в каталоге ~/.kde.
Интерфейс kmail не дает возможность удалить ящики?
Нет, не дает. Почти всё контекстное меню для этой папки неактивно. Причем, учетка уже выпилена, осталось только IMAP дерево от неё, причем даже не все...
в ~/.kde. тоже ничего нет. Я там в первую очередь смотрел. Во всяком случае глазами ничего не вижу и find ~/.kde/ -name *kmail* и find ~/.kde/ -name *mail* ничего не возвращает.
В итоге помогло rm -rf ./.config/akonadi*. Да слишком кардинально, но сработало.