наверное какой-то скрипт нужно писать?
Именно. Небольшой скриптик. Что-то вроде
<как_копируем> <что_копируем> <куда_копируем>
Например, если хотим копировать напрямую по ssh
#!/bin/bash
scp -r /что/хотим/скопировать <пользователь>@<адрес_второго_компа>:/каталог/где/хранятся/бэкапы/
В этом случае надо будет сначала настроить ssh-авторизацию по ключу, чтоб пароль не запрашивало постоянно.
Или можно сначала смонтировать удаленный каталог опять же через ssh, но копировать туда уже как в локальный:
сначала монтируем
sshfs <пользователь>@<адрес_второго_компа>:/каталог/где/хранятся/бэкапы/ /точка/монтирования
а потом копируем
cp -Ru /что/хотим/скопировать /точка/монтирования/
Если хочется можно эти файлы заархивировать, тогда нужно добавить
tar czf backup_`date +%Y-%m-%d`.tar.gz /путь/к/файлам/которые/хотим/сохранить
Ну и так далее.