Если хотите "серьёзный", то бишь железный рейд из двух дисков - рекомендую контроллер 3Ware 8006-2LP (или его аналог для ATA, не помню номера). Несколько дней назад установил Харди на RAID1 без всяких проблем. Не знаю как к нему относятся творения MS, но на офф сайте (контроллера) написано что поддерживается, двайверы соотвествующие тоже прилагаются.
Более чем уверен, что есть тьма более дешёвых, "нежелезных", карточек, которые также будут совметимы с линуксом, просто привёл пример который проверен на личном опыте. Если решите покупать какой-либо контроллер - помимо офф сайта рекомендую почитать отзывы в западных интернет магазинах(newegg.com например) - там всегда много полезной информации о совместимости и не только.