А у вас точно 12.04? Как раз между версиями 12.04 и 14.04 произошла "революция" переключателя раскладки, и баг, который вы описываете, словили многие. Баг заключался в том, что если пытаться переназначить клавиши с дефолтного хоткея на какой-нибудь другой, то возможность переключения раскладки исчезала вовсе.