До копирования:
udev 16417236 8 16417228 1% /dev
tmpfs 3285660 1580 3284080 1% /run
/dev/sdb1 49082176 8900680 37665172 20% /
none 4 0 4 0% /sys/fs/cgroup
tmpfs 6291456 20 6291436 1% /tmp
none 5120 0 5120 0% /run/lock
none 16428280 76 16428204 1% /run/shm
none 102400 64 102336 1% /run/user
/dev/sda1 961301832 251252236 661195172 28% /home
/dev/sdc1 488383484 377528556 110854928 78% /media/redbeatles-ubuntu/Hitachi
2585 redbeat+ 20 0 1169216 281236 108100 S 11,0 0,9 0:12.40 firefox
2111 redbeat+ 20 0 1400652 134908 79960 S 4,7 0,4 0:05.09 compiz
1341 root 20 0 331712 118728 91564 S 3,0 0,4 0:06.40 Xorg
2132 redbeat+ 20 0 484784 20328 16144 S 0,7 0,1 0:00.83 indicator-multi
1447 redbeat+ 20 0 40172 3604 2184 S 0,3 0,0 0:00.42 dbus-daemon
1585 redbeat+ 20 0 590352 62132 24036 S 0,3 0,2 0:01.53 unity-panel-ser
2766 redbeat+ 20 0 655832 33336 22936 S 0,3 0,1 0:00.40 gnome-terminal
1 root 20 0 33884 4376 2660 S 0,0 0,0 0:00.73 init
2 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kthreadd
3 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/0
4 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/0:0
5 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/0:0H
6 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/u16:0
7 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.08 rcu_sched
8 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcu_bh
9 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.04 rcuos/0
10 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/0
11 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/0
12 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/0
13 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/1
14 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/1
15 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/1
16 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/1:0
17 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/1:0H
18 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.02 rcuos/1
19 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/1
20 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/2
21 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/2
22 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/2
23 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/2:0
24 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/2:0H
25 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.02 rcuos/2
26 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/2
27 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/3
28 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/3
29 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/3
30 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/3:0
31 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/3:0H
32 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.02 rcuos/3
33 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/3
34 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/4
35 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/4
MemTotal: 32856564 kB
MemFree: 30838040 kB
MemAvailable: 31580160 kB
Buffers: 109488 kB
Cached: 828008 kB
SwapCached: 0 kB
Active: 1115880 kB
Inactive: 653164 kB
Active(anon): 832704 kB
Inactive(anon): 53160 kB
Active(file): 283176 kB
Inactive(file): 600004 kB
Unevictable: 16 kB
Mlocked: 16 kB
SwapTotal: 0 kB
SwapFree: 0 kB
Dirty: 32 kB
Writeback: 0 kB
AnonPages: 831628 kB
Mapped: 363716 kB
Shmem: 54324 kB
Slab: 92088 kB
SReclaimable: 55768 kB
SUnreclaim: 36320 kB
KernelStack: 8736 kB
PageTables: 28552 kB
NFS_Unstable: 0 kB
Bounce: 0 kB
WritebackTmp: 0 kB
CommitLimit: 16428280 kB
Committed_AS: 4152212 kB
VmallocTotal: 34359738367 kB
VmallocUsed: 161684 kB
VmallocChunk: 34359488508 kB
HardwareCorrupted: 0 kB
AnonHugePages: 108544 kB
CmaTotal: 0 kB
CmaFree: 0 kB
HugePages_Total: 0
HugePages_Free: 0
HugePages_Rsvd: 0
HugePages_Surp: 0
Hugepagesize: 2048 kB
DirectMap4k: 174932 kB
DirectMap2M: 4976640 kB
DirectMap1G: 29360128 kB
Причем, как оказалось, данная проблема даже при условии копирования с одного и тогоже диска, т.к. действия в папке home! Винчестер стоит Western Digital Blue 1TB 7200rpm 64MB WD10EZEX 3.5 SATA III. Заметил, что HDD сначала читает с себя со скоростью ~180Mb/sec а потом с такой же скоростью пишет. Промежутки примерно секунд по 10. Никгда не ображал внимания, может так и дорлжно быть.
После копирования файла ZIP рамером 13Gb:
udev 16417236 8 16417228 1% /dev
tmpfs 3285660 1580 3284080 1% /run
/dev/sdb1 49082176 8900684 37665168 20% /
none 4 0 4 0% /sys/fs/cgroup
tmpfs 6291456 40 6291416 1% /tmp
none 5120 0 5120 0% /run/lock
none 16428280 80 16428200 1% /run/shm
none 102400 68 102332 1% /run/user
/dev/sda1 961301832 264240544 648206864 29% /home
/dev/sdc1 488383484 377528556 110854928 78% /media/redbeatles-ubuntu/Hitachi
2585 redbeat+ 20 0 1718468 508624 135636 R 10,6 1,5 1:53.33 firefox
2111 redbeat+ 20 0 1405312 157036 80024 S 4,0 0,5 0:29.55 compiz
1341 root 20 0 332696 119660 91908 S 2,7 0,4 0:26.00 Xorg
2766 redbeat+ 20 0 655448 33508 22936 S 1,0 0,1 0:01.02 gnome-terminal
1585 redbeat+ 20 0 590468 62464 24104 S 0,7 0,2 0:04.44 unity-panel-ser
2132 redbeat+ 20 0 484784 20328 16144 S 0,7 0,1 0:04.51 indicator-multi
1524 redbeat+ 20 0 23572 1916 1660 S 0,3 0,0 0:00.54 upstart-dbus-br
1531 redbeat+ 20 0 363668 7620 5880 S 0,3 0,0 0:02.70 ibus-daemon
1694 redbeat+ 20 0 360524 9200 7936 S 0,3 0,0 0:01.98 indicator-appli
1749 redbeat+ 20 0 206724 6604 6020 S 0,3 0,0 0:00.85 ibus-engine-sim
1 root 20 0 33884 4376 2660 S 0,0 0,0 0:00.73 init
2 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kthreadd
3 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/0
4 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/0:0
5 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/0:0H
7 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.31 rcu_sched
8 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcu_bh
9 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.12 rcuos/0
10 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/0
11 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/0
12 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/0
13 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/1
14 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/1
15 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/1
16 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/1:0
17 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/1:0H
18 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.07 rcuos/1
19 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/1
20 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/2
21 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/2
22 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 ksoftirqd/2
23 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/2:0
24 root 0 -20 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 kworker/2:0H
25 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.11 rcuos/2
26 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 rcuob/2
27 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 watchdog/3
28 root rt 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.00 migration/3
29 root 20 0 0 0 0 S 0,0 0,0 0:00.0
MemTotal: 32856564 kB
MemFree: 4196736 kB
MemAvailable: 31271192 kB
Buffers: 116688 kB
Cached: 26816200 kB
SwapCached: 0 kB
Active: 1400580 kB
Inactive: 26610748 kB
Active(anon): 1079608 kB
Inactive(anon): 53176 kB
Active(file): 320972 kB
Inactive(file): 26557572 kB
Unevictable: 16 kB
Mlocked: 16 kB
SwapTotal: 0 kB
SwapFree: 0 kB
Dirty: 324 kB
Writeback: 0 kB
AnonPages: 1078488 kB
Mapped: 373800 kB
Shmem: 54348 kB
Slab: 487156 kB
SReclaimable: 449328 kB
SUnreclaim: 37828 kB
KernelStack: 8496 kB
PageTables: 29664 kB
NFS_Unstable: 0 kB
Bounce: 0 kB
WritebackTmp: 0 kB
CommitLimit: 16428280 kB
Committed_AS: 4607352 kB
VmallocTotal: 34359738367 kB
VmallocUsed: 161836 kB
VmallocChunk: 34359488508 kB
HardwareCorrupted: 0 kB
AnonHugePages: 382976 kB
CmaTotal: 0 kB
CmaFree: 0 kB
HugePages_Total: 0
HugePages_Free: 0
HugePages_Rsvd: 0
HugePages_Surp: 0
Hugepagesize: 2048 kB
DirectMap4k: 187220 kB
DirectMap2M: 6012928 kB
DirectMap1G: 28311552 kB