Eduard86, я так понимаю, AnrDaemon хочет сказать, что если есть временные требования, то нужно использовать систему реального времени, а не полагаться на случайные совпадения в работе планировщика.
С другой стороны, если с планировщиком винды повезло, и программа работает как нужно, то может повезти и с каким-нибудь Linuxовым планировщиком. Задача вроде не промышленная, так почему бы не поэкспериментировать - попробуйте разные планировщики с разным приоритетом процесса...