Открываешь терминал, набираешь команду:
sudo gparted
Откроется окно. Интерфейс понятный и на русском. В правом вернем углу выбираешь в выпадающем списке устройство - свою флешку, скорее всего будет /dev/sdb или /dev/sdc, ориентируйся по размеру. Размонтируй флешку, удаляй все разделы, создавай один большой на весь размер флешки, форматируй в файловую систему, которая тебе нужна.