Тема иконок "indicator-keyboard-En", "indicator-keyboard-Ru", отображаются как квадратики черного цвета с белым шрифтом. Пробобовал по совету компизомании ставить, предварительно удалив стоявшие, но итог не порадовал, флаги в папке есть а иконки прежние. Буду рыть дальше, может что то получится, а может нет.