Вы, похоже, не отдаёте себе отчёта, что то, что вам показывает терминал и то, что грузится в вебсервер - это две большие разницы?
Посмотреть путь к ini-файлу CLI у вас ума хватило, а посмотреть тот же путь для модуля, загруженного в Апач - нет?
И, вероятно, для вас будет открытием, что эти параметры можно переопределить ещё в двух местах?
Смотрите настройки виртуального сервера, и на будущее старайтесь не менять глобальные параметры без большой необходимости.
Не просто так в phpinfo() всегда две колонки - глобальная настройка и локальная, действующая в текущий момент времени.