При установке глобального обновления на Windows 10, по сути происходит нечто похожее на переустановку системы, но в автоматическом режиме. Мной было замечено, на многих машинах, что при этих моментах система меняет разметку на диске создавая дополнительно для технических нужд раздел объёмом примерно 500 мб. Этот раздел в последствии можно удалить, но при следующем большом обновлении, всё повториться вновь. Да и не помню,от какого именно раздела ОС откусывает эти 500 мб. Не буду утверждать, что именно это является причиной проблемы, но теоретически возможно. Не исключено так же, что это может происходить не у всех, возможно это может зависеть, от разметки диска, один или более ntfs разделов, но опять это просто мысли вслух...