Может и бывает какой-то специальный аппаратно-программный пароль для HDD, но скорее всего проблема решается просто:
1) Вставляем и аппаратно подключаем HDD.
2) Загружаем Ubuntu.
3) Запускаем Nautilus из Терминала с правами Суперпользователя:
sudo nautilus
4) Перемещаемся в каталог /media. В нём находим каталог (скорее всего с длинным буквенно-цифровым названием), который должен отображать содержимое HDD.
5) На искомом каталоге нажимаем правой клавишей мыши, идём в Свойства/Права. Там меняем пользователя и группу на свои (по логину пользователя) и даём нужные права. "Остальным" можно права доступа или не давать, или ограничить только чтением, например.
6) Закрываем окно настроек, закрываем Nautilus, закрываем Терминал.
7) Открываем Nautilus обычным способом. Всё. Должно работать.