Если вкратце, то долгое время было достаточно сложно совместно использовать pulseaudio и jack, так как pulse написан сами знаете кем, сами знаете как, он хотел играть напрямую в альсу не признавая никого вокруг. Но со временем ситуация устаканилась и в мире аудио пришли к схеме pulseaudio -> jack -> alsa -> звуковая карта. Был написан специальный модуль который выступает приёмником для пульса (а в него шлют практически все программы в Linux, кроме специализированных которые позволяют выбрать куда звук слать, да пары плееров поумнее типа vlc, clementine), затем отправляет этот поток в jack где уже можно звук маршрутизировать и обрабатывать как душе угодно. В KXStudio есть специальная утилитка Cadence, являющаяся центром конфигурации, в ней есть раздел jack bridges - вам туда. Сначала лучше поставить именно их сборку и немного освоится на полностью коробочном варианте, а потом уже можно просто их репозиторий к своей системе подключить и поставить только jack, этот самый бридж не помню как пакет зовётся, да ladish для удобства маршрутизации.