Тогда не знаю, в чём дело. У меня в Ubutu-16.04 все /dev/ttyS* имеют права 660 и я для этого ничего не предпринимал.
/etc/rc.local пустой, в /lib/udev/rules.d/ для них правила нет, да я и сомневаюсь, что оно должно быть,
в /etc/init.d/setserial права тоже не назначаются. М.б., они назначаются в какой-нибудь политике.
Попробуйте дать команду как root:
dpkg-reconfigure setserial