alang, как я уже писал, вроде бы нету у меня битых пакетов, ни synaptic ни sudo apt-get -f install пакетов с ошибками не видят. Да и программы устанавливаются нормально.
etamax2018, спасибо за ответ, но извините за глупый вопрос, а как узнать какая версия libegl1-mesa нужна и как её установить? Через Synaptic во вкладке "пакет" -> "версия" есть только ещё одна версия 11.2.0-1ubuntu2 (xenial), сейчас установлена 12.0.6-0ubuntu0.16.04.1 (now). Должен ли я доустановить 11.2.0-1ubuntu2 (xenial), заменить текущий пакет libegl1-mesa на версию 11.2.0-1ubuntu2 (xenial), или установить какую-то иную версию?