Ярослав Батуев, вирус под Linux найти крайне сложно: домашние компы с их зоопарком систем запаришься взламывать, а выхлопа ноль. Что вируса в файле нет - это хорошо, но к Ubuntu это вообще ни каким боком. И почему вы решили, что у вас полетел именно суперблок, вы это определили с помощью какой-то диагностики или это просто ваша догадка? Хотелось бы тогда эту диагностику увидеть.
Так же не понятно, как у вас не запускается Ubuntu. Не запускается совсем (то есть даже не начинает и пункт выбора системы в GRUB не реагирует); повисает на бесконечной загрузке; показывает "чёрный/фиолетовый экран" с ошибками или без оных; бесконечно отправляет на экран входа в учётку, даже когда вводишь правильный пароль? Вот нет от вас данных, ждём.
Если не реагирует GRUB, то его нужно чинить: как минимум копнуть его на предмет корректности точек монтирования и правильности UUID винчестера. А может нужно его (GRUB) переустановить.
Если бесконечная загрузка, или не помогла переустановка GRUB, то или проблема с драйверами или начал физически сыпаться винт (не обязательно суперблок). Смотрим SMART винта и разбираемся.
Если чёрный экран, то кроме проблем с диском могут быть проблемы с запуском x-сервера или просто слетел видеодрайвер.
На случай бесконечного логина тоже есть свое решение, в нашей wiki.