pyurik, дайте угадаю...
sudo chmod -R ugo+x ./
# или
sudo chmod -R a+x ./
# или
sudo chmod -R 777 ./
Как вернуть? Ну может там не у всех файлов надо снять атрибут исполнения, но следующая команда это сделет
find $HOME -type f -execute chmod a-x {} \;
P.S. А имеено "папки" должны иметь атрибут исполнения (х) ибо без него вы ее не откроете