А как в биосе компа установите дистанционно приоритет загрузки с другого диска?
С помощью контроллера удалённого управления. Он аппаратный, к нему подведен отдельный линк.
Тогда нет никаких проблем. Изучите внимательно возможность "Clonezilla" и с её помощью просто создадите копию диска.
Вкратце, Вам не нужна флешка, качаете zip архив с сайта, достаёте их архива каталог live-hd и копируете в корень системного диска.
Затем в Grub, в файле /etc/grub.d/40_custom создаёте запись для загрузки в Clonezilla:
# добавить в конец файла такие строки:
menuentry "Clonezilla live" {
search --no-floppy --fs-uuid --set XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
linux /live-hd/vmlinuz boot=live union=overlay username=user config components quiet noswap nolocales edd=on nomodeset \
ocs_live_run=\"ocs-live-general\" ocs_live_extra_param=\"\" keyboard-layouts=NONE ocs_live_batch=\"no\" locales=ru_RU.UTF-8 \
vga=788 ip=frommedia nosplash live-media-path=/live-hd toram=filesystem.squashfs
initrd /live-hd/initrd.img
}
Вместо ХХХХХХХХХХХХХХ - uuid раздела, на которой установлена система
Его можно посмотреть в файле /etc/fstab раздел "/" или командой blkid
Потом перегружаете сервер, выбираете в меню загрузку "Clonezilla live" и делате просто клонирование с диска на диск.
Будет создана фотографическая копия диска, после чего в биосе меняете загрузочный диск и всё.