система лежит на разделе размером 39G, но считает, что у неё места - только 20G
Применив клонезилу, получишь образ, размером 39гб. Или того хуже, если сохранишь все устройство. Восстановив из него получишь то, с чего начал.
Кардинальное отличие, в скваш сохраняются только файлы-каталоги. Если на разделе занято, например, 10гб, то сохранится только эти 10гб плюс сожмутся примерно в три раза.
Соответственно можно будет восстановить даже на раздел, размером 10гб. В отличие от тарбола, скваш оптимизирован для произвольного доступа, т.е быстрее добраться до какого-то отдельного файла в архиве.
То что получилось у тебя после этих крахов вообще не поддается анализу. Я бы этому не доверял.