Не запускаются с иконки установленные приложения

[xat55]

Здравствуйте.
Обнаружил такой неприятный момент. Например, есть у меня установленные phpstorm, atom, skype. Все эти приложения установлены в папке snab. Суть в том, что по нажатию на иконку этих приложений, запуск приложений не происходит, НО запустить эти приложения из терминала можно и они запускаются.

Что надо сделать, чтобы эти приложения запускались с иконки?

П.С. Раньше, все запускалось с иконок, но потом изменилось. Есть подозрение, что файлы gnome из папки snab как-то влияют...