Почему на второй диск, Windows ещё стоит на первом ? Если Windows есть, в каком режиме установлена... уефай-легаси ? При установке первый винт отсоединял что-ли ? Путь куда указал для установки grub-а ? С флешки не грузит (с той откуда устанавливал) потому, что в Биос не выбран диск, с которого грузится нужно, в данном случае для лайф режима выбираем флешку. В Биос можно не входить, а делать выбор по горячей клавише. Почитать-найти в сети какая она у тебя к ноуту твоему или к матери.