Под КДЕ в КUbuntu это тоже имеет место.
На всём диске есть только каталог /home/user/.gconf/* и у рута ещё один.
В нём нет каталога peripherals и остальных
Есть
/usr/share/desktop-directories/kde-settings-peripherals.directory
/usr/share/desktop-directories/kde-utilities-peripherals.directory
/usr/share/gconf/schemas/desktop_gnome_peripherals_keyboard.schemas
/usr/share/gconf/schemas/desktop_gnome_peripherals_mouse.schemas
В какой-то момент умирают вообще все горячие клавиши, но раскладку переключать получается ранее настроенным капслоком. Единственный раз недавно удалось исполнить танцевальное па на клавиатуре так, что закрылся демон переключения раскладок, откликающийся в трее на мышь. Раньше, и не факт что в КUbuntu и Ubuntu (возможно в АСП), удавалось запустить хоткеи каким-то хитрым рестартом приложения в котором работал (забыл как).
Упоминание о проблеме всплывает, решения не нашёл.
P.S. Речь не о разнице рус-лат раскладок. Дохнет какой-то демон и пропадает отклик на горячие клавиши в любой раскладке.