EvgenWeb, Вас не понимают, потому, что вы решаете какую то несуществующую проблему. Не должно у вас возникать таких вопросов впринципе. Скорей всего у вас нет ни какой проблемы вообще!
Работать от root пользователя нет ни одной причины, установка приложения не в /home не означает, что для работы требуется root. В общем открывайте справку, и учитесь устанавливать ОС с нуля, скорей всего это единственное, что можно посоветовать в данной ситуации, так чтобы не навредить...
Или, сформулируйте свой вопрос иначе, чтобы на него возможно было дать ответ.