Может просто установить заново, сайт, вроде, живой? https://atom.io
Выше писал, что это несколько раз делал...
Решил вопрос.
Атом можно устанавливать разными способами. У меня не Атом не устанавливался через "Менеджер приложений". Вроде, установился, но не запускается.
В итоге, запустил команду
sudo snap install atom --classic
Появилась вторая такая же иконка атома в "Приложения". И обе не запускались. Решил удалить Атом, установленный через "Менеджер приложений".
Попробовал запустить оставшуюся иконку, все получилось, Атом запустился!!!
П.С. И даже все пользовательские настройки сохранились.