Конфигурационные файлы PHP находятся в каталоге /etc/php/версия_php/fpm, там и нужно править.
Кроме того максимальный размер передаваемых файлов нужно указывать и в nginx, в файле /etc/nginx/nginx.conf, директивой:
client_max_body_size
Если значение этой директивы установить в 0, то Nginx не будет проверять размер контента
Кстати, после правки конфигов, необходимо перезагружать службу, пример для php
systemctl restart php7.4-fpm