как правильно их смонтировать(в какие разделы) при установке?
Чем меньше ты будешь монтировать при установке, тем правильней. В идеале, устанавливаешь систему в один раздел. Все остельное потом, когда узнаешь зачем это тебе нужно. Пока-что ты не знаешь и кроме проблем лишние разделы-монтирования ничего тебе не принесут.
оставшееся место перемонтировать как домашний(home)
Типичное заблуждение тех, кто не знает, зачем это нужно. Хоме в системе должен быть только свой, не нужно его куда-то тащить.
как поступить с хдд, куда монтировать его
Почитай FHS. В частности про каталоги /mnt, /media.
У тебя есть сейчас система. Посмотри там, куда монтируется по умолчанию (/media<username>/<uuid_or_label>), сделай выводы.