Можно, почитайте "man alsactl". Я этим когда-то воспользовался, чтобы сохранить настройки в домашнем каталоге,
а при входе они восстанавливаются скриптом в ~/config/autostart. Общесистемные сохраняются в /var/lib/alsa/asound.state,
если их сохранить как root, кажется, даже просто при выходе из alsamixer,
тогда они будут восстанавливаться при старте системы.