"...просто ты не умеешь их готовить."
Вариантов больше одного. Зависит от потребностей.
настроить систему (тема, фон, профиль терминала) а потом скопировать все эти настройки
Для гнома, все эти настройки находятся в файле ~/.config/dconf/user. Просто скопировать файл, только изменить владельца файла.
загрузчик grub
Конфиг груба находится в файле /boot/grub/grub.cfg. Просто взять и скопировать.
найти эти низкоуровневые утилиты? Может подскажите...
Тебе даже уже подсказывали. Например, gsettings для работы с ~/.config/dconf/user.
Здесь совсем недавно приводил пример.
Аналогично, для работы с темой оформления - gresource.
Груб, для пользовательских настроек файл /etc/grub.d/40_custom.
Еще вариант, технически более сложный. Монтирование с помошью оверлейной файловой системы. Так можно смонтировать не только настройки, но и программы, и всю систему.