Столько постов понаписали, и никто не спросил, а какая там файловая система на флешке?
Уж не ntfs ли случайно?
Тогда да, при регулярном извлечении как попало, флешки из ПК очень даже может потребоваться вставка её в ПК с виндой.
fsck.ntfs пока не изобрели.
Встречал такое на сломанных "вёндах", которые сами уже загрузиться не могут и в попытках восстановления блокируют файловую систему.
И пока Windows не загрузится нормально или диск не будет проверен с помощью другой винды, диск в GNU/Linux читаться не будет.