Восстановит загрузчик винды, а Linux перестанет грузиться. Альтернатива, имхо, дискпарту или восстановлению виндовому считаю приложение Bootice. Можно просто запустить и посмотреть как загрузка прописана, если ничего не трогать, то просмотром ничего не испортим. Поскольку обе системы установлены в режиме uefi, в Bootice выбираем опцию правки uefi.
Для новичков ставить системы в параллель в одном режиме справедливо если устанавливаем на один диск. Справится с загрузчиками если вторая система на другом диске проще, если на присоединённом система установлена в Legasy. При такой установке загрузчик Linux-а не полезет в виндовый загрузочный раздел перезаписывая его. Ведь загрузчик будет прописан при установке на весь присоединяемый диск. Единственное неудобство это выбор нужной системы (Linux) через вызов горячей клавишей загрузочного меню Биос в случае если присоединены оба диска.