Есть папка с настройками, туда и лОжить?
Для начала, ударение. Правильно - класть. Шутка.
С позиции единственного DC и единственного пользователя, вполне разумное место. Хотя, для исполняемых более подходяще ~/.local. Скомпилирован DC немного своеобразно, некоторые свои ресурсы (scripts, plugins) ищет в месте нахождения исполняемого файла. При таком раскладе, скрипту более логично находиться рядом с исполняемым файлом.
А если скрипт более универсален, чем для одного DC, то и место ему в общей иерархии.
Можно на панели инструментов...
Неплохо. При ширине экрана 2000 пикселей, сотня-другая поместится. Может и не так часто понадобятся, но постоянно радуют глаз, а что это там такое розовенькое зеленеет. Вот сейчас ткну! А нет, не оно! Вон та, белёненькая, наверное... быть может... Кто-же это намутил!
Отъел пару строк по вертикали от списка. Сделаю шрифт меньше. Но так ничего не видно.