попробуй
apt-get install mail-notification
обычный мэйл-нотифаер,болтается в трее,сообщает о мессаджах.К почтовым программам отношения не имеет.
Если необходимо,просто любое приложение,не только Тандерберд,в трей загнать,то:
sudo apt-get install alltray