Я, конечно не хочу навязываться, но чем гадать на кофейной гуще может все-таки слазаете в файл
/boot/grub/menu.lst
и найдете там строку
#kopt=root=bla,bla,bla......
это опции для вновь устанавливаемого ядра. На всякий случай еще раз, для тех, кто не понял - то, что написано в вашем файле вместо root=bla,bla,bla при установке нового ядра будет добавлено ему в качестве опций загрузки. Если там написано (hd1,0) то и в строке kernel для свежеустановленного ядра будет прописано (hd1,0) невзирая ни на что.