"в винде стоит владелец root?" - в винде никаких владельцев. Там просто установлены атрибуты "Только чтение" которые видимо установились из-под Убунты. Заходил под Администратором Винды, также не могу убрать "Только чтение".
"а почему бы не использовать флешку с FAT32" - это на втором выносном винчестере

, поэтому на этом менять не собираюсь.
Скажите, где вобще можно почитать про права и их изменение кроме встроенной справки (читал)? А также какие программы могут повлиять на эти самые права?
Грешу на Самбу, потому как проблема возникла после попытки открыть общий доступ на папку в LAN. (наверное надо было сначало об этом сказать)