Вопрос читал внимательно. Но можно и в Наутилусе, если установлен сценарий "открыть от рут".
Открыв родительский каталог как рут, правой мышью по папке и переходим на закладку "права".
***************
Открыть файлы как root.
gedit $HOME/.gnome2/nautilus-scripts/Open\ as\ root
Вставьте следующие строки в новый файл
for uri in $NAUTILUS_SCRIPT_SELECTED_URIS; do
gksudo "gnome-open $uri" &
done
Сохраните файл. Выполнить:
chmod +x $HOME/.gnome2/nautilus-scripts/Open\ as\ root
Кликните правой кнопкой мыши на файле -> Cценарии -> Open as root
******************