Получилось! 
Для тех кому нужно:
- Не запускайте ibexpert до окончания всех танцев с бубном. Если вы уже сделали это - удалите папку .wine в своей домашней директории. (если удалили - запустите и закройте winecfg, чтоб он снова ее создал)
- качаем dcom98.exe с сайта мелкомягких и закидываем в ~/.wine/drive_c/windows/system32/
- зайдите в winecfg и установите wine в режим win98
- выполняем в терминале:
rm ~/.wine/drive_c/windows/system32/ole32.dll
rm ~/.wine/drive_c/windows/system32/oleaut32.dll
WINEDLLOVERRIDES="ole32=n" wine DCOM98.EXE
- заходим в winecfg во вкладку библиотеки и добавляем там ole32 (стороняя), oleaut32 (стороняя)
- после этого вы можете вернуть wine обратно в режим Win-XP, если вам нужно
- ставим ibexpert
Проверено на Ubuntu 8.10 + WINE 1.1.17
Оригинал мануала (англ):
http://appdb.winehq.org/objectManager.php?sClass=version&iId=9049&iTestingId=15285