Сомнительно. Пакеты, которые ставились, как зависимости - они удаляются пакетным менеджерам автоматически, во время удаления покета, который от них зависит.
А удалято малоиспользуемую прогу - ИМХО не удобно. Я вот месяца 2 диски не писал, и че теперь, все писалки снести? А сколько системных утилит, которые нужны мне очень редко, но иногда без них никак, например флешку мне с NTFS принесли, а она мне дрова к ней грохнула, т.к. я ими не пользуюсь. ИМХО если нехватает места на диске, то лезь в менеджер пакетов и удаляй то, что тебе не надо.