Как понимаю, htmldir - это переменная, значение которой указывает программе munin, куда, необходимо записывать картинки с графиками. Какие манипуляции с графиками в этой директории будут производиться и какими средствами, это уже вопрос третий.
Согласен, можно было и символическую ссылку сделать.
Вопрос, был в том, почему графики не обновлялись?
В общем, проглядел одну вещь, смотрим /var/log/munin/munin-update.log:
..............
Окт 22 12:25:03 [28160] - Unable to update /var/lib/munin/localdomain/localhost.localdomain-cpu-irq-d.rrd: opening '/var/lib/munin/localdomain/localhost.localdomain-cpu-irq-d.rrd': Permission denied
Окт 22 12:25:03 [28160] - Unable to update /var/lib/munin/localdomain/localhost.localdomain-cpu-softirq-d.rrd: opening '/var/lib/munin/localdomain/localhost.localdomain-cpu-softirq-d.rrd': Permission denied
..............
После выполнения команды графики стали обновляться:# chmod 777 -R /var/lib/munin/localdomain
Всё.