Ну я в принципе понимаю, почему он парит
две подсети а браузер один вот и парится бедняга.
Правильно делать (моё предположение) в каждой подсети по браузеру, один из которых становится главным, а второй сливает ему информацию.
Надо почитать руководство можно ли сразу две подсетки обслуживать (я имею в виду обзор сети), но что-то у меня некоторые сомнения.
Как вариант сделайте его основным обозревателем, посмотрим что будет.
domain master = yes
Вот здесь чётко написано
"When Samba is the domain master and the master browser, it will listen for master announcements (made roughly every 12 minutes) from LMBs on other subnets and then contact them to synchronize browse lists. "
То есть каждые 12 минут самба в роли доменного мастера и мастера браузера своей сети опрашивает другие локальные обозреватели в своих подсетях и затем синхронизирует списки.
Вам, имхо придётся либо все компы запихивать в 1 подсеть или ещё один обозреватель сети в другой подсетке необходим.