А я поддержу Yurror.
Если вам разрешено копировать через буфер обмена с терминалки, то вы можете скопировать с неё что угодно. Поэтому запрет на копирование файлов с терминалки не имеет смысла. Именно поэтому нужно решать проблему административно, то есть, грубо говоря, обращением к хозяину терминалки.
Про разный формат буфера обмена уже сказали.
Переписать, наверное, можно.