Утилита sed.
Пример. Вместо 2 пробелов оставляется только один.
sed 's/ / /g' file_input > file_output
Пробелов стало лишь двое меньше

>Помогите найти программу автоматически удаляющую лишние символы "пробела" !
sed -r 's/ +/ /g' file_input > file_output
или
>после каждой строки растут пробелы,
sed -r 's/ +$//g' file_input > file_output
Здесь удаление пробелов будет только в конце строки.