перерыл уже все настройки копыт - ничего не помогает. Дело в том, что такие же окна появляются при отправлении на печать и других действиях.
Пользователь решил продолжить мысль 30 Октября 2009, 16:50:53:
Нашел! Отвечает за эти красивые окошечки демон notify-osd.